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Nike Free 3.0 V4 Femme le même temps les contraintes explicites

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Dans cet article, nous étendons la refonte des protéines itératif Basket Nike Free Run 2 Femme et optimisation (IPRO) cadre pour la conception des bibliothèques de protéines avec une spécificité de ligand ciblée. Les mutations qui minimisent l'énergie de liaison avec le ligand désiré sont identifiés. Dans le même temps les contraintes explicites sont introduites qui maintiennent l'énergie de liaison pour tous les ligands leurres dessus d'un seuil nécessaire pour la liaison réussie. Le cadre proposé est démontrée par calcul en modifiant la spécificité de liaison de l'effecteur de régulation de la transcription bactérienne de protéine AraC, appartenant à la famille AraC / XylS de régulateurs transcriptionnels pour différents ligands non naturels. Les résultats obtenus démontrent l'importance de supprimer systématiquement l'énergie de liaison pour les ligands concurrents. Repérer un petit ensemble de mutations au sein de la poche de liaison améliore considérablement la différence dans Nike Free 3.0 V4 Femme les énergies liaison entre ligands ciblées et leurres, même quand ils sont très semblables.
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